Author Affiliations
Abstract
1 The Key Laboratory of Weak-Light Nonlinear Photonics of Education Ministry, School of Physics and TEDA Institute of Applied Physics, Nankai University, Tianjin 300071, P. R. China
2 State Key Laboratory of Medicinal Chemical Biology, Frontiers Science Center for Cell Responses, College of Life Sciences, Nankai University, Tianjin 300071, P. R. China
3 Shenzhen Research Institute of Nankai University, Shenzhen, Guangdong, 518083, P. R. China
4 Collaborative Innovation Center of Extreme Optics, Shanxi University, Taiyuan, Shanxi 030006, P. R. China
Collective cell migration is a coordinated movement of multi-cell systems essential for various processes throughout life. The collective motions often occur under spatial restrictions, hallmarked by the collective rotation of epithelial cells confined in circular substrates. Here, we aim to explore how geometric shapes of confinement regulate this collective cell movement. We develop quantitative methods for cell velocity orientation analysis, and find that boundary cells exhibit stronger tangential ordering migration than inner cells in circular pattern. Furthermore, decreased tangential ordering movement capability of collective cells in triangular and square patterns are observed, due to the disturbance of cell motion at unsmooth corners of these patterns. On the other hand, the collective cell rotation is slightly affected by a convex defect of the circular pattern, while almost hindered with a concave defect, also resulting from different smoothness features of their boundaries. Numerical simulations employing cell Potts model well reproduce and extend experimental observations. Together, our results highlight the importance of boundary smoothness in the regulation of collective cell tangential ordering migration.
Collective cell migration spatial restrictions tangential ordering geometric regulation cell Potts model 
Journal of Innovative Optical Health Sciences
2024, 17(2): 2450001
侯梦迪 1胡芬 1,**杨建宇 1董浩 1潘雷霆 1,2,3,4,*
作者单位
摘要
1 弱光非线性光子学教育部重点实验室,南开大学物理科学学院,泰达应用物理研究院,天津 300071
2 药物化学生物学全国重点实验室,南开大学生命科学学院,细胞应答交叉科学中心,天津 300071
3 南开大学深圳研究院,广东 深圳 518083
4 山西大学极端光学协同创新中心,山西 太原 030006
核孔复合物(NPC)是细胞核膜上由多种蛋白组装而成的复杂结构,在细胞核质交换和信息传递中起着关键作用。单分子定位超分辨成像(SMLM)以其特异性和高成像分辨率成为研究NPC超微结构的主要方法之一。然而,由于抗体标记不完全等因素导致的数据丢失,给后续分析带来了困难。笔者使用SMLM提供的定位信息,结合基于密度的空间聚类算法(DBSCAN)和层次聚类算法进行数据的提取和分类,建立了NPC筛选和定位的分析流程,并采用该处理流程得到了缺失较少且形貌比较均匀的核孔。进一步,基于最小二乘法原理对筛选得到的大量NPC进行质心对齐的重构处理,成功复现出了其经典的八重对称结构,并揭示了核孔蛋白Nup133与Nup98的精确相对位置关系。本研究通过建立核孔筛选和重构的标准流程,填补了SMLM数据的缺失。采用该流程对多种核孔蛋白进行分析,揭示它们的结构特性。所建流程为理解核孔的复杂结构提供了一种高通量的定量分析方法。
生物光学 超分辨成像 单分子定位 核孔复合物 聚类算法 重构 
中国激光
2024, 51(3): 0307106
张格 1杨向飞 1王晓勇 1董浩 1[ ... ]严纯华 1,2,**
作者单位
摘要
1 北京大学 化学与分子工程学院,稀土材料化学及应用国家重点实验室,北京大学⁃香港大学稀土材料与生物无机化学联合实验室,北京分子科学中心,北京 100871
2 兰州大学 化学化工学院,甘肃 兰州 730000
近年来,将近红外光转换为短波长的可见或近红外光的稀土纳米晶上转换发光研究吸引了生物成像、纳米温度传感、太阳能电池等领域研究者的广泛关注。面向多领域的应用需求,稀土纳米晶上转换发光需提高其发光强度、发光波长以及激发波长的选择性。本文综述了纳米尺度上,通过组成、结构以及核壳结构的设计,在理解上转换发光过程的能量传递路径和上转换发光过程的基础上,提高对上转换发光的颜色、各跃迁的比例以及发光强度、发光寿命等调控的研究进展。此外,还关注了纳米晶与贵金属表面电场、表面有机分子以及环境温度的耦合在提高辐射跃迁几率、减少无辐射能量损失等方面提高其上转换发光强度的研究发展趋势。
稀土纳米晶 上转换发光 核壳结构 rare earth nanocrystals upconversion emission core/shell structure 
发光学报
2023, 44(7): 1149
杨建宇 1胡芬 1,*侯梦迪 1董浩 1[ ... ]潘雷霆 1,2,3,4,**
作者单位
摘要
1 弱光非线性光子学教育部重点实验室,南开大学物理科学学院,泰达应用物理研究院,天津 300071
2 药物化学生物学国家重点实验室,南开大学生命科学学院,细胞应答交叉科学中心,天津 300071
3 南开大学深圳研究院,广东 深圳 518083
4 极端光学协同创新中心,山西大学,山西 太原 030006
成熟人红细胞膜骨架是由膜下多种蛋白组成的三角晶格网状结构,在维持红细胞形态、变形性、运动和代谢等功能方面扮演着重要角色。单分子定位超分辨成像(SMLM)技术在解析骨架超微结构方面展现出了强大的能力,但分辨率的提升对成像分析手段提出了更高要求。作为一种常用的空间分析方法,Vorono?分割在SMLM图像聚类分析中已被广泛应用。笔者利用自主搭建的SMLM超分辨成像系统获得红细胞膜蛋白和骨架蛋白的超分辨点簇图像,对点簇质心进行Vorono?分割,并对Vorono?多边形面积分布进行伽马函数拟合,发现自由膜蛋白CD59的伽马分布峰值对应的x轴坐标xpeak为0.78。结合模拟结果,验证了自由膜蛋白CD59呈随机分布。进一步,肌动蛋白、血影蛋白N端和原肌球蛋白的Vorono?分析结果显示它们的xpeak均为0.86,而锚蛋白的xpeak为0.84,说明骨架膜蛋白呈相对均匀的分布状态,但锚蛋白较其他骨架蛋白更具随机性。Vorono?方法可助力阐释红细胞膜骨架蛋白的空间分布特性,同时也为点簇状SMLM超分辨图像数据的深入提取提供了新思路和新方法。
生物光学 超分辨成像 单分子定位 红细胞膜骨架 图像分割 Voronoï分析 
中国激光
2023, 50(15): 1507104
邵晶 1,2,*李卓 1,2聂真威 3董浩 1,2[ ... ]赵发财 6
作者单位
摘要
1 青岛理工大学山东省激光绿色智能制造与设备协同创新中心,山东 青岛 266520
2 工业流体节能与污染控制教育部重点实验室,山东 青岛 266520
3 中国科学院长春光学精密机械与物理研究所,吉林 长春 130033
4 北京长峰科威光电技术有限公司,北京 100195
5 中国科学院大学,北京 100049
6 中国电子科技集团公司第四十一研究所,山东 青岛 266555
为抑制光学系统内部的杂散光反射,设计了一种具有非对称特征的新型微结构。该微结构通过减少镜面反射的方式,防止外部杂散光到达光学系统像面位置。为实现对非对称微结构的激光高速加工制备,提出了激光振镜加工系统进行倾斜加工的新方式。设计了新型的高速激光加工平台,制备了非对称的铝基微结构,并搭建了镜面反射测试实验和仿真综合实验对样品进行对比测试。结果表明,加工样品对杂散光具有良好的抑制效果。当设定入射角度为15°、照明光束为650 nm激光时,该微结构与常规的阳极氧化表面相比,抑制杂散光的性能提高了10倍,相对反射率仅为0.008%。
光学设计 微结构制备 纳秒激光 激光材料加工 杂散光抑制 
光学学报
2023, 43(11): 1122001
作者单位
摘要
1 上海交通大学材料科学与工程学院,上海 200240
2 上海市激光制造与材料改性重点实验室,上海 200240
研究了激光功率正弦调制对AZ31镁合金焊缝熔深和工艺气孔的影响。保持激光功率恒定在1500 W,将焊接速度从3.0 m/min逐步增加到4.0 m/min,观察了匙孔周期性开闭行为,分析了不同反射次数对高反射材料匙孔能量分布的影响规律。在不同焊接速度下采用激光功率正弦调制,调制幅度为500 W,调制频率从50 Hz逐步增加至200 Hz,统计了焊缝熔深和工艺气孔率的变化趋势。试验结果表明:对于高反射材料,激光功率调制效果与匙孔内光束反射次数有关,反射次数较多的匙孔具有较大深宽比,匙孔底部累积能量高,深度变化滞后于激光功率变化,激光功率调制有助于增加熔深。激光功率正弦调制不利于镁合金匙孔稳定,50 Hz低频调制显著增加工艺气孔,调制频率为150 Hz时激光功率正弦调制对匙孔稳定性的影响较小。
激光技术 镁合金 高反射材料 深熔焊 功率调制 匙孔 
中国激光
2023, 50(12): 1202103
Author Affiliations
Abstract
1 State Key Laboratory of High Field Laser Physics and CAS Center for Excellence in Ultra-intense Laser Science, Shanghai Institute of Optics and Fine Mechanics, Chinese Academy of Sciences, Shanghai 201800, China
2 University of Chinese Academy of Sciences, Beijing 100049, China
3 School of Physical Science and Technology, ShanghaiTech University, Shanghai 201210, China
The plasma mirror system was installed on the 1 PW laser beamline of Shanghai Superintense Ultrafast Laser Facility (SULF) for enhancing the temporal contrast of the laser pulse. About 2 orders of magnitude improvement on pulse contrast was measured on picosecond and nanosecond time scales. The experiments show that high-contrast laser pulses can significantly improve the cutoff energy and quantity of proton beams. Then different target distributions are assumed in particles in cell simulations, which can qualitatively assume the expansion of nanometer-scale foil. The high-contrast laser enables the SULF-1PW beamline to generally be of benefit for many potential applications.
ultraintense laser plasma mirror high-contrast laser proton acceleration 
Chinese Optics Letters
2023, 21(4): 043802
Author Affiliations
Abstract
1 The Key Laboratory of Weak-Light Nonlinear Photonics of Education Ministry, School of Physics and TEDA Institute of Applied Physics, Nankai University, Tianjin 300071 P. R. China
2 State Key Laboratory of Medicinal Chemical Biology, Frontiers Science Center for Cell Responses, College of Life Sciences, Nankai University, Tianjin 300071, P. R. China
3 Collaborative Innovation Center of Extreme Optics, Shanxi University, Taiyuan Shanxi 030006, P. R. China
4 Shenzhen Research Institute of Nankai University, Shenzhen, Guangdong 518083, P. R. China
Actin cytoskeleton plays crucial roles in various cellular functions. Extracellular matrix (ECM) can modulate cell morphology by remodeling the internal cytoskeleton. To define how geometry of ECM regulates the organization of actin cytoskeleton, we plated individual NIH 3T3 cells on micropatterned substrates with distinct shapes and sizes. It was found that the stress fibers could form along the nonadhesive edges of T-shaped pattern, but were absent from the opening edge of V-shaped pattern, indicating that the organization of actin cytoskeleton was dependent on the mechanical environment. Furthermore, a secondary actin ring was observed on 50μm circular pattern while did not appear on 30μm and 40μm pattern, showing a size-dependent organization of actin cytoskeleton. Finally, osteoblasts, MDCK and A549 cells exhibited distinct organization of actin cytoskeleton on T-shaped pattern, suggesting a cell-type specificity in arrangement of actin cytoskeleton. Together, our findings brought novel insight into the organization of actin cytoskeleton on micropatterned environments.Actin cytoskeleton plays crucial roles in various cellular functions. Extracellular matrix (ECM) can modulate cell morphology by remodeling the internal cytoskeleton. To define how geometry of ECM regulates the organization of actin cytoskeleton, we plated individual NIH 3T3 cells on micropatterned substrates with distinct shapes and sizes. It was found that the stress fibers could form along the nonadhesive edges of T-shaped pattern, but were absent from the opening edge of V-shaped pattern, indicating that the organization of actin cytoskeleton was dependent on the mechanical environment. Furthermore, a secondary actin ring was observed on 50μm circular pattern while did not appear on 30μm and 40μm pattern, showing a size-dependent organization of actin cytoskeleton. Finally, osteoblasts, MDCK and A549 cells exhibited distinct organization of actin cytoskeleton on T-shaped pattern, suggesting a cell-type specificity in arrangement of actin cytoskeleton. Together, our findings brought novel insight into the organization of actin cytoskeleton on micropatterned environments.
Actin cytoskeleton photolithography micropatterning extracellular matrix 
Journal of Innovative Optical Health Sciences
2023, 16(2): 2244005
作者单位
摘要
1 南开大学弱光非线性光子学教育部重点实验室,物理科学学院,泰达应用物理研究院,天津 300071
2 南开大学细胞应答交叉科学中心,药物化学生物学国家重点实验室,生命科学学院,天津 300071
3 南开大学深圳研究院,广东 深圳 518083
4 山西大学极端光学协同创新中心,太原 山西 030006
膜蛋白在细胞膜上的时空分布形式决定了其活性状态及功能,在调控细胞生命活动过程中起着重要作用。单分子定位超分辨成像(SMLM)技术为在纳米尺度解析膜蛋白的空间分布提供了可能,但分辨率的极大提升对图像准确聚类分割提出了更高要求。基于密度的空间聚类算法(DBSCAN)是常用的聚类方法之一,但其对于膜蛋白分布不均匀的SMLM超分辨图像的分割效果往往不太理想。本文提出了一种结合多次DBSCAN和层次聚类的混合聚类算法,该算法以DBSCAN方法为分割基础,通过进一步的面积阈值分析和层次聚类,在保持超分辨点簇图像精确聚类识别的前提下,仍能保留每个点簇内的多次定位信号。将该算法应用于模拟数据集和实验数据分割得到的轮廓系数等性能普遍优于传统DBSCAN算法。这种混合聚类方法为膜蛋白SMLM超分辨图像的聚类分割提供了新思路和新方法,有助于更精准地分析膜蛋白在纳米尺度上的空间分布信息。
生物光学 单分子定位超分辨成像 超分辨图像分割 膜蛋白 基于密度的空间聚类算法 层次聚类算法 
中国激光
2023, 50(3): 0307106
邓泽宇 1,2杨小涵 1,2张锦文 1,2赵浩然 1,2[ ... ]沈杰 1,*
作者单位
摘要
1 北京大学材料科学与工程学院,北京 100871
2 北京大学化学与分子工程学院,北京 100871
稀土类发光材料由于其丰富的光学特性而具有重要的研究与应用价值。其中,稀土上转换发光材料在近年来尤为受人瞩目,与之相关的研究成果遍布物理、化学、生物、材料和多个交叉领域。有别于大多数发光材料的共性,上转换材料的激发-发射谱峰波长呈现为反斯托克斯位移,因此能够在短波长谱带范围绕过背景噪声且传输发光信息。作为对这一光物理机制的理解运用,人们通过化学方法合成了纳米尺度的稀土上转换发光材料,并且在生物样品荧光显微成像中成功证实了上转换发光标记物的高信噪比检测。以上转换发光微纳材料的光物理性质研究为主题,介绍和梳理了稀土上转换纳米材料在偏振光谱解析、单纳米颗粒超分辨发光成像、微型激光器构筑方面的研究进展。
材料 稀土上转换发光 发光偏振性 超分辨成像 微型激光 
中国激光
2023, 50(1): 0113005

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